Protein–RNA interactions for Protein: P07350

Ifna6, Interferon alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna6P07350 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifna6P07350 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifna6P07350 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifna6P07350 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifna6P07350 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifna6P07350 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifna6P07350 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna6P07350 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna6P07350 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna6P07350 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna6P07350 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna6P07350 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna6P07350 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna6P07350 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna6P07350 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna6P07350 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna6P07350 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna6P07350 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna6P07350 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifna6P07350 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifna6P07350 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifna6P07350 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifna6P07350 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifna6P07350 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifna6P07350 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifna6P07350 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifna6P07350 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifna6P07350 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifna6P07350 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifna6P07350 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifna6P07350 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifna6P07350 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifna6P07350 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifna6P07350 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifna6P07350 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifna6P07350 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifna6P07350 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifna6P07350 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifna6P07350 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifna6P07350 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifna6P07350 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifna6P07350 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifna6P07350 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifna6P07350 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifna6P07350 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifna6P07350 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifna6P07350 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifna6P07350 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifna6P07350 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifna6P07350 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifna6P07350 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifna6P07350 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifna6P07350 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifna6P07350 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifna6P07350 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms