Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Apoa4P06728 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Apoa4P06728 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms