Protein–RNA interactions for Protein: P06334

T-cell receptor gamma chain C region DFL12, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06334 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06334 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06334 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06334 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P06334 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06334 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06334 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06334 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06334 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06334 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06334 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06334 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P06334 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06334 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06334 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06334 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06334 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P06334 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P06334 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06334 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06334 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06334 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06334 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06334 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06334 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P06334 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06334 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06334 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06334 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06334 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06334 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06334 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06334 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06334 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06334 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06334 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06334 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06334 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P06334 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06334 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06334 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P06334 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06334 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06334 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06334 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06334 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06334 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06334 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06334 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06334 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06334 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06334 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06334 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06334 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06334 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06334 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06334 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06334 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06334 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06334 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P06334 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P06334 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06334 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P06334 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P06334 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06334 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06334 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
P06334 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06334 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06334 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06334 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06334 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06334 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P06334 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P06334 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06334 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P06334 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06334 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06334 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06334 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P06334 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06334 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06334 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06334 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
P06334 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P06334 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06334 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P06334 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P06334 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06334 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P06334 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P06334 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06334 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06334 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06334 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06334 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P06334 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06334 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P06334 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P06334 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms