Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06323 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06323 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06323 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P06323 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06323 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06323 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06323 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06323 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P06323 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06323 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06323 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06323 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06323 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P06323 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06323 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06323 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06323 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06323 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06323 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06323 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06323 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06323 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06323 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06323 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06323 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06323 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06323 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06323 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06323 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06323 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06323 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06323 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06323 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06323 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06323 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06323 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P06323 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06323 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06323 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06323 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P06323 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06323 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P06323 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P06323 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06323 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06323 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06323 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06323 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06323 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06323 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06323 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06323 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06323 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06323 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06323 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06323 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06323 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06323 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P06323 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P06323 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P06323 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P06323 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P06323 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P06323 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P06323 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P06323 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P06323 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P06323 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P06323 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P06323 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06323 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06323 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06323 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06323 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06323 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06323 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06323 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06323 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06323 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06323 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06323 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06323 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06323 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06323 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06323 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06323 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06323 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P06323 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P06323 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P06323 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P06323 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P06323 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P06323 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P06323 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P06323 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P06323 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P06323 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06323 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P06323 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms