Protein–RNA interactions for Protein: P06321

T-cell receptor beta chain V region A20.2.25, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06321 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P06321 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P06321 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P06321 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P06321 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P06321 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P06321 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P06321 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P06321 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P06321 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
P06321 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P06321 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
P06321 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P06321 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P06321 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P06321 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
P06321 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P06321 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
P06321 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
P06321 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
P06321 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P06321 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P06321 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P06321 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P06321 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P06321 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P06321 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P06321 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P06321 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
P06321 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
P06321 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P06321 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P06321 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P06321 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P06321 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P06321 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P06321 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P06321 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P06321 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P06321 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
P06321 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P06321 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P06321 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
P06321 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P06321 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P06321 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
P06321 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P06321 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
P06321 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P06321 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P06321 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P06321 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
P06321 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P06321 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P06321 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P06321 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P06321 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P06321 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P06321 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P06321 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P06321 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P06321 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P06321 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P06321 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P06321 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P06321 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P06321 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P06321 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P06321 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P06321 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P06321 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P06321 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P06321 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P06321 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P06321 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P06321 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P06321 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P06321 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P06321 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P06321 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P06321 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P06321 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P06321 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P06321 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P06321 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P06321 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P06321 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P06321 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P06321 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
P06321 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P06321 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P06321 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P06321 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P06321 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P06321 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P06321 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
P06321 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P06321 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P06321 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P06321 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms