Protein–RNA interactions for Protein: P05627

Jun, Transcription factor AP-1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JunP05627 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
JunP05627 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
JunP05627 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
JunP05627 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
JunP05627 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
JunP05627 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
JunP05627 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
JunP05627 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
JunP05627 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
JunP05627 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
JunP05627 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
JunP05627 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
JunP05627 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
JunP05627 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
JunP05627 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
JunP05627 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
JunP05627 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
JunP05627 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
JunP05627 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
JunP05627 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
JunP05627 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
JunP05627 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
JunP05627 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
JunP05627 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
JunP05627 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
JunP05627 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
JunP05627 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
JunP05627 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
JunP05627 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
JunP05627 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
JunP05627 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
JunP05627 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
JunP05627 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
JunP05627 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
JunP05627 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
JunP05627 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
JunP05627 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
JunP05627 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
JunP05627 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
JunP05627 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
JunP05627 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
JunP05627 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
JunP05627 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
JunP05627 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
JunP05627 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
JunP05627 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
JunP05627 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
JunP05627 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
JunP05627 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
JunP05627 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
JunP05627 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
JunP05627 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
JunP05627 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
JunP05627 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
JunP05627 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
JunP05627 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
JunP05627 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
JunP05627 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
JunP05627 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
JunP05627 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
JunP05627 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
JunP05627 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
JunP05627 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
JunP05627 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
JunP05627 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
JunP05627 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
JunP05627 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
JunP05627 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
JunP05627 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
JunP05627 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
JunP05627 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
JunP05627 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
JunP05627 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
JunP05627 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
JunP05627 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
JunP05627 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
JunP05627 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
JunP05627 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
JunP05627 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
JunP05627 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
JunP05627 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
JunP05627 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
JunP05627 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
JunP05627 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
JunP05627 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
JunP05627 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
JunP05627 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
JunP05627 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
JunP05627 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
JunP05627 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
JunP05627 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
JunP05627 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
JunP05627 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
JunP05627 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
JunP05627 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
JunP05627 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
JunP05627 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
JunP05627 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
JunP05627 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
JunP05627 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms