Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tgfb1P04202 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tgfb1P04202 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tgfb1P04202 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tgfb1P04202 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tgfb1P04202 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tgfb1P04202 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tgfb1P04202 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tgfb1P04202 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tgfb1P04202 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tgfb1P04202 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tgfb1P04202 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tgfb1P04202 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tgfb1P04202 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tgfb1P04202 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tgfb1P04202 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tgfb1P04202 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tgfb1P04202 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tgfb1P04202 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tgfb1P04202 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tgfb1P04202 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tgfb1P04202 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tgfb1P04202 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tgfb1P04202 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tgfb1P04202 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tgfb1P04202 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tgfb1P04202 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tgfb1P04202 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tgfb1P04202 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tgfb1P04202 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tgfb1P04202 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tgfb1P04202 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tgfb1P04202 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tgfb1P04202 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tgfb1P04202 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tgfb1P04202 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tgfb1P04202 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tgfb1P04202 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tgfb1P04202 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tgfb1P04202 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tgfb1P04202 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tgfb1P04202 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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