Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Hoxa7P02830 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Hoxa7P02830 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Hoxa7P02830 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Hoxa7P02830 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Hoxa7P02830 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxa7P02830 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxa7P02830 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxa7P02830 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxa7P02830 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxa7P02830 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxa7P02830 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hoxa7P02830 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxa7P02830 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hoxa7P02830 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxa7P02830 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxa7P02830 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxa7P02830 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxa7P02830 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxa7P02830 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hoxa7P02830 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxa7P02830 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxa7P02830 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hoxa7P02830 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxa7P02830 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxa7P02830 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxa7P02830 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxa7P02830 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxa7P02830 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxa7P02830 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxa7P02830 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxa7P02830 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxa7P02830 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxa7P02830 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxa7P02830 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hoxa7P02830 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxa7P02830 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxa7P02830 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxa7P02830 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxa7P02830 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxa7P02830 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxa7P02830 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hoxa7P02830 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxa7P02830 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxa7P02830 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxa7P02830 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxa7P02830 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxa7P02830 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxa7P02830 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxa7P02830 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxa7P02830 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxa7P02830 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxa7P02830 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxa7P02830 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxa7P02830 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxa7P02830 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Hoxa7P02830 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxa7P02830 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxa7P02830 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxa7P02830 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxa7P02830 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hoxa7P02830 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxa7P02830 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxa7P02830 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxa7P02830 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxa7P02830 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxa7P02830 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxa7P02830 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hoxa7P02830 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hoxa7P02830 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms