Protein–RNA interactions for Protein: P02463

Col4a1, Collagen alpha-1(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a1P02463 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col4a1P02463 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col4a1P02463 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col4a1P02463 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col4a1P02463 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col4a1P02463 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col4a1P02463 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Col4a1P02463 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Col4a1P02463 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Col4a1P02463 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Col4a1P02463 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Col4a1P02463 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Col4a1P02463 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col4a1P02463 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Col4a1P02463 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col4a1P02463 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col4a1P02463 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col4a1P02463 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col4a1P02463 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col4a1P02463 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Col4a1P02463 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col4a1P02463 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Col4a1P02463 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col4a1P02463 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col4a1P02463 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col4a1P02463 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Col4a1P02463 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col4a1P02463 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col4a1P02463 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col4a1P02463 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col4a1P02463 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col4a1P02463 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col4a1P02463 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Col4a1P02463 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Col4a1P02463 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col4a1P02463 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col4a1P02463 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col4a1P02463 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col4a1P02463 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col4a1P02463 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Col4a1P02463 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Col4a1P02463 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Col4a1P02463 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Col4a1P02463 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Col4a1P02463 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Col4a1P02463 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Col4a1P02463 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Col4a1P02463 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Col4a1P02463 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Col4a1P02463 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Col4a1P02463 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col4a1P02463 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col4a1P02463 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col4a1P02463 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col4a1P02463 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col4a1P02463 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Col4a1P02463 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col4a1P02463 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col4a1P02463 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Col4a1P02463 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col4a1P02463 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col4a1P02463 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col4a1P02463 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col4a1P02463 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Col4a1P02463 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col4a1P02463 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col4a1P02463 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col4a1P02463 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col4a1P02463 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Col4a1P02463 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col4a1P02463 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col4a1P02463 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col4a1P02463 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Col4a1P02463 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Col4a1P02463 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Col4a1P02463 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Col4a1P02463 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col4a1P02463 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col4a1P02463 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Col4a1P02463 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Col4a1P02463 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Col4a1P02463 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Col4a1P02463 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Col4a1P02463 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Col4a1P02463 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Col4a1P02463 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Col4a1P02463 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Col4a1P02463 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col4a1P02463 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col4a1P02463 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col4a1P02463 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col4a1P02463 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col4a1P02463 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Col4a1P02463 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col4a1P02463 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col4a1P02463 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col4a1P02463 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col4a1P02463 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Col4a1P02463 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Col4a1P02463 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms