Protein–RNA interactions for Protein: P01735

T-cell receptor beta chain V region 86T1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01735 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
P01735 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
P01735 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
P01735 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
P01735 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
P01735 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
P01735 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
P01735 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
P01735 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
P01735 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
P01735 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
P01735 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
P01735 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
P01735 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
P01735 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
P01735 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
P01735 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
P01735 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
P01735 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
P01735 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
P01735 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
P01735 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
P01735 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
P01735 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
P01735 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
P01735 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
P01735 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
P01735 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
P01735 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
P01735 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
P01735 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
P01735 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
P01735 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
P01735 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
P01735 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P01735 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P01735 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P01735 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
P01735 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
P01735 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P01735 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P01735 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
P01735 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P01735 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P01735 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P01735 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
P01735 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P01735 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P01735 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P01735 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P01735 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P01735 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
P01735 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P01735 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P01735 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
P01735 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P01735 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P01735 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P01735 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01735 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01735 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01735 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01735 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01735 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01735 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01735 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01735 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01735 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01735 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01735 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01735 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01735 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01735 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01735 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01735 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01735 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
P01735 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01735 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01735 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01735 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P01735 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P01735 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P01735 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P01735 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
P01735 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P01735 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
P01735 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P01735 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01735 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01735 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01735 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01735 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01735 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01735 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
P01735 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01735 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01735 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01735 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01735 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01735 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms