Protein–RNA interactions for Protein: P01734

T-cell receptor beta chain V region 3H.25, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01734 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01734 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01734 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01734 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01734 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01734 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01734 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01734 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P01734 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01734 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01734 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
P01734 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P01734 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
P01734 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01734 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01734 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01734 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01734 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01734 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01734 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01734 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01734 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01734 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01734 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01734 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01734 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P01734 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01734 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01734 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01734 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01734 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
P01734 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01734 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01734 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01734 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01734 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01734 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01734 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01734 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01734 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01734 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
P01734 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01734 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01734 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01734 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01734 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01734 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
P01734 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
P01734 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01734 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01734 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01734 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01734 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01734 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01734 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01734 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01734 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01734 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01734 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01734 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01734 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01734 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01734 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01734 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01734 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01734 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01734 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01734 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
P01734 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01734 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P01734 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P01734 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P01734 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
P01734 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P01734 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01734 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01734 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01734 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01734 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01734 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01734 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01734 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01734 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
P01734 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01734 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01734 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01734 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01734 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01734 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01734 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01734 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01734 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01734 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
P01734 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01734 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01734 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01734 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01734 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01734 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P01734 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms