Protein–RNA interactions for Protein: P01672

Ig kappa chain V-III region PC 7940, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01672 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01672 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01672 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01672 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01672 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01672 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01672 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01672 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01672 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01672 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01672 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01672 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01672 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01672 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01672 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01672 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01672 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01672 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01672 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01672 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01672 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01672 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
P01672 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01672 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01672 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01672 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01672 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01672 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
P01672 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01672 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01672 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01672 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01672 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01672 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01672 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01672 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01672 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P01672 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
P01672 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P01672 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
P01672 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P01672 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
P01672 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
P01672 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
P01672 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
P01672 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
P01672 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
P01672 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01672 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01672 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01672 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01672 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01672 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01672 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01672 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01672 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01672 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01672 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
P01672 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01672 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01672 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01672 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01672 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01672 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
P01672 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01672 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01672 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01672 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01672 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01672 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01672 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01672 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01672 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01672 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01672 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01672 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01672 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01672 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01672 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01672 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01672 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01672 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01672 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01672 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01672 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01672 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01672 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01672 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01672 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01672 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01672 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01672 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01672 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01672 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01672 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01672 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01672 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01672 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01672 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01672 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms