Protein–RNA interactions for Protein: P00520

Abl1, Tyrosine-protein kinase ABL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abl1P00520 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abl1P00520 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abl1P00520 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Abl1P00520 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abl1P00520 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abl1P00520 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abl1P00520 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abl1P00520 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abl1P00520 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Abl1P00520 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Abl1P00520 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Abl1P00520 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abl1P00520 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abl1P00520 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abl1P00520 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abl1P00520 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abl1P00520 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abl1P00520 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abl1P00520 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abl1P00520 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abl1P00520 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abl1P00520 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abl1P00520 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abl1P00520 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abl1P00520 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abl1P00520 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abl1P00520 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abl1P00520 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abl1P00520 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abl1P00520 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abl1P00520 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Abl1P00520 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abl1P00520 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abl1P00520 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abl1P00520 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abl1P00520 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Abl1P00520 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abl1P00520 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abl1P00520 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abl1P00520 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abl1P00520 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abl1P00520 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Abl1P00520 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abl1P00520 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abl1P00520 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms