Protein–RNA interactions for Protein: P00397

Mtco1, Cytochrome c oxidase subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtco1P00397 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mtco1P00397 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mtco1P00397 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Mtco1P00397 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mtco1P00397 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mtco1P00397 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mtco1P00397 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mtco1P00397 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mtco1P00397 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mtco1P00397 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Mtco1P00397 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mtco1P00397 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mtco1P00397 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mtco1P00397 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mtco1P00397 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mtco1P00397 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mtco1P00397 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mtco1P00397 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mtco1P00397 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mtco1P00397 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mtco1P00397 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mtco1P00397 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Mtco1P00397 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mtco1P00397 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mtco1P00397 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mtco1P00397 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mtco1P00397 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mtco1P00397 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mtco1P00397 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mtco1P00397 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mtco1P00397 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mtco1P00397 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mtco1P00397 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mtco1P00397 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mtco1P00397 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mtco1P00397 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mtco1P00397 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mtco1P00397 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Mtco1P00397 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mtco1P00397 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mtco1P00397 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mtco1P00397 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mtco1P00397 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Mtco1P00397 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mtco1P00397 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mtco1P00397 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mtco1P00397 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mtco1P00397 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mtco1P00397 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mtco1P00397 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mtco1P00397 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mtco1P00397 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mtco1P00397 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mtco1P00397 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mtco1P00397 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mtco1P00397 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Mtco1P00397 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mtco1P00397 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mtco1P00397 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mtco1P00397 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mtco1P00397 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mtco1P00397 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mtco1P00397 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mtco1P00397 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mtco1P00397 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mtco1P00397 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mtco1P00397 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mtco1P00397 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mtco1P00397 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Mtco1P00397 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mtco1P00397 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mtco1P00397 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mtco1P00397 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Mtco1P00397 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mtco1P00397 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mtco1P00397 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mtco1P00397 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mtco1P00397 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mtco1P00397 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mtco1P00397 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mtco1P00397 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mtco1P00397 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mtco1P00397 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mtco1P00397 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mtco1P00397 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mtco1P00397 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mtco1P00397 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mtco1P00397 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mtco1P00397 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mtco1P00397 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Mtco1P00397 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mtco1P00397 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mtco1P00397 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Mtco1P00397 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mtco1P00397 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mtco1P00397 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Mtco1P00397 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mtco1P00397 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mtco1P00397 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mtco1P00397 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms