Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccl20O89093 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccl20O89093 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms