Protein–RNA interactions for Protein: O88632

Sema3f, Semaphorin-3F, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3fO88632 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sema3fO88632 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sema3fO88632 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sema3fO88632 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Sema3fO88632 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sema3fO88632 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Sema3fO88632 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sema3fO88632 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sema3fO88632 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sema3fO88632 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sema3fO88632 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sema3fO88632 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sema3fO88632 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sema3fO88632 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Sema3fO88632 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Sema3fO88632 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Sema3fO88632 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sema3fO88632 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sema3fO88632 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sema3fO88632 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sema3fO88632 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sema3fO88632 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sema3fO88632 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sema3fO88632 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sema3fO88632 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sema3fO88632 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sema3fO88632 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sema3fO88632 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sema3fO88632 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sema3fO88632 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema3fO88632 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema3fO88632 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema3fO88632 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema3fO88632 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sema3fO88632 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sema3fO88632 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sema3fO88632 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sema3fO88632 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sema3fO88632 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sema3fO88632 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sema3fO88632 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sema3fO88632 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sema3fO88632 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sema3fO88632 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sema3fO88632 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sema3fO88632 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sema3fO88632 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sema3fO88632 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sema3fO88632 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sema3fO88632 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sema3fO88632 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sema3fO88632 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms