Protein–RNA interactions for Protein: O88602

Cacng2, Voltage-dependent calcium channel gamma-2 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng2O88602 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacng2O88602 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cacng2O88602 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacng2O88602 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacng2O88602 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacng2O88602 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacng2O88602 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacng2O88602 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacng2O88602 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cacng2O88602 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacng2O88602 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacng2O88602 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacng2O88602 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacng2O88602 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacng2O88602 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacng2O88602 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacng2O88602 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacng2O88602 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacng2O88602 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacng2O88602 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cacng2O88602 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacng2O88602 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacng2O88602 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacng2O88602 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacng2O88602 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacng2O88602 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacng2O88602 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacng2O88602 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacng2O88602 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacng2O88602 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacng2O88602 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cacng2O88602 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacng2O88602 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacng2O88602 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacng2O88602 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacng2O88602 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacng2O88602 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacng2O88602 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacng2O88602 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacng2O88602 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacng2O88602 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacng2O88602 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacng2O88602 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacng2O88602 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacng2O88602 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacng2O88602 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacng2O88602 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cacng2O88602 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cacng2O88602 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cacng2O88602 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacng2O88602 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacng2O88602 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacng2O88602 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacng2O88602 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacng2O88602 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacng2O88602 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacng2O88602 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacng2O88602 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacng2O88602 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cacng2O88602 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacng2O88602 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacng2O88602 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacng2O88602 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacng2O88602 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacng2O88602 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacng2O88602 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacng2O88602 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacng2O88602 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cacng2O88602 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacng2O88602 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacng2O88602 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacng2O88602 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacng2O88602 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacng2O88602 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacng2O88602 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacng2O88602 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacng2O88602 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacng2O88602 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cacng2O88602 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacng2O88602 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacng2O88602 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacng2O88602 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacng2O88602 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacng2O88602 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacng2O88602 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacng2O88602 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacng2O88602 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacng2O88602 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cacng2O88602 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacng2O88602 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacng2O88602 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacng2O88602 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacng2O88602 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacng2O88602 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacng2O88602 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacng2O88602 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacng2O88602 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacng2O88602 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacng2O88602 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cacng2O88602 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms