Protein–RNA interactions for Protein: O88587

Comt, Catechol O-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ComtO88587 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ComtO88587 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ComtO88587 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ComtO88587 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ComtO88587 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ComtO88587 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ComtO88587 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ComtO88587 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ComtO88587 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ComtO88587 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ComtO88587 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ComtO88587 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ComtO88587 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ComtO88587 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ComtO88587 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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ComtO88587 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ComtO88587 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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ComtO88587 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ComtO88587 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
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ComtO88587 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ComtO88587 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ComtO88587 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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ComtO88587 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ComtO88587 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ComtO88587 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ComtO88587 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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ComtO88587 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ComtO88587 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ComtO88587 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ComtO88587 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ComtO88587 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ComtO88587 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ComtO88587 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ComtO88587 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ComtO88587 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ComtO88587 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ComtO88587 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ComtO88587 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ComtO88587 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ComtO88587 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ComtO88587 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ComtO88587 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ComtO88587 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ComtO88587 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ComtO88587 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ComtO88587 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ComtO88587 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ComtO88587 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ComtO88587 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ComtO88587 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ComtO88587 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ComtO88587 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ComtO88587 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ComtO88587 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ComtO88587 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ComtO88587 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ComtO88587 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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ComtO88587 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ComtO88587 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ComtO88587 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ComtO88587 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ComtO88587 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ComtO88587 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ComtO88587 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ComtO88587 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ComtO88587 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ComtO88587 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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ComtO88587 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ComtO88587 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ComtO88587 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ComtO88587 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ComtO88587 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ComtO88587 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ComtO88587 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ComtO88587 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ComtO88587 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ComtO88587 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ComtO88587 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ComtO88587 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ComtO88587 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ComtO88587 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ComtO88587 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ComtO88587 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ComtO88587 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ComtO88587 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ComtO88587 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ComtO88587 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ComtO88587 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ComtO88587 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ComtO88587 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ComtO88587 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms