Protein–RNA interactions for Protein: O70583

Mid1, E3 ubiquitin-protein ligase Midline-1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1O70583 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Mid1O70583 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mid1O70583 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mid1O70583 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mid1O70583 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mid1O70583 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mid1O70583 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mid1O70583 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mid1O70583 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mid1O70583 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mid1O70583 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mid1O70583 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mid1O70583 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mid1O70583 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Mid1O70583 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mid1O70583 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Mid1O70583 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mid1O70583 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mid1O70583 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mid1O70583 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mid1O70583 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Mid1O70583 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mid1O70583 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mid1O70583 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mid1O70583 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mid1O70583 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Mid1O70583 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mid1O70583 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mid1O70583 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mid1O70583 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mid1O70583 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mid1O70583 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mid1O70583 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mid1O70583 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mid1O70583 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mid1O70583 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mid1O70583 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mid1O70583 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mid1O70583 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Mid1O70583 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mid1O70583 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mid1O70583 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mid1O70583 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mid1O70583 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mid1O70583 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mid1O70583 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms