Protein–RNA interactions for Protein: O54946

Dnajb6, DnaJ homolog subfamily B member 6, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb6O54946 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Dnajb6O54946 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Dnajb6O54946 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dnajb6O54946 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dnajb6O54946 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dnajb6O54946 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dnajb6O54946 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnajb6O54946 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnajb6O54946 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnajb6O54946 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnajb6O54946 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnajb6O54946 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnajb6O54946 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnajb6O54946 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnajb6O54946 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnajb6O54946 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnajb6O54946 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnajb6O54946 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnajb6O54946 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnajb6O54946 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnajb6O54946 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnajb6O54946 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnajb6O54946 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnajb6O54946 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnajb6O54946 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnajb6O54946 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnajb6O54946 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnajb6O54946 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnajb6O54946 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnajb6O54946 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnajb6O54946 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnajb6O54946 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnajb6O54946 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnajb6O54946 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnajb6O54946 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnajb6O54946 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnajb6O54946 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnajb6O54946 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnajb6O54946 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnajb6O54946 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnajb6O54946 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnajb6O54946 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnajb6O54946 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnajb6O54946 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnajb6O54946 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnajb6O54946 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnajb6O54946 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnajb6O54946 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnajb6O54946 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms