Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarce1O54941 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarce1O54941 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarce1O54941 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarce1O54941 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarce1O54941 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smarce1O54941 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarce1O54941 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarce1O54941 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarce1O54941 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarce1O54941 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarce1O54941 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarce1O54941 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarce1O54941 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarce1O54941 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarce1O54941 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarce1O54941 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarce1O54941 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smarce1O54941 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarce1O54941 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarce1O54941 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarce1O54941 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarce1O54941 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Smarce1O54941 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarce1O54941 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarce1O54941 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarce1O54941 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarce1O54941 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarce1O54941 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarce1O54941 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarce1O54941 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarce1O54941 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smarce1O54941 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarce1O54941 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarce1O54941 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarce1O54941 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarce1O54941 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarce1O54941 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smarce1O54941 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarce1O54941 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarce1O54941 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarce1O54941 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarce1O54941 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarce1O54941 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarce1O54941 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarce1O54941 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarce1O54941 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smarce1O54941 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarce1O54941 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarce1O54941 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarce1O54941 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarce1O54941 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarce1O54941 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarce1O54941 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarce1O54941 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smarce1O54941 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarce1O54941 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarce1O54941 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarce1O54941 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarce1O54941 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarce1O54941 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smarce1O54941 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarce1O54941 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarce1O54941 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarce1O54941 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarce1O54941 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarce1O54941 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smarce1O54941 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarce1O54941 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarce1O54941 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarce1O54941 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarce1O54941 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smarce1O54941 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smarce1O54941 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 226.9 ms