Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Csnk2a2O54833 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Csnk2a2O54833 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Csnk2a2O54833 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Csnk2a2O54833 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Csnk2a2O54833 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Csnk2a2O54833 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Csnk2a2O54833 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Csnk2a2O54833 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Csnk2a2O54833 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Csnk2a2O54833 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Csnk2a2O54833 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Csnk2a2O54833 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Csnk2a2O54833 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csnk2a2O54833 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csnk2a2O54833 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csnk2a2O54833 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csnk2a2O54833 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csnk2a2O54833 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csnk2a2O54833 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csnk2a2O54833 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csnk2a2O54833 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Csnk2a2O54833 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Csnk2a2O54833 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Csnk2a2O54833 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Csnk2a2O54833 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Csnk2a2O54833 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csnk2a2O54833 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csnk2a2O54833 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csnk2a2O54833 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Csnk2a2O54833 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Csnk2a2O54833 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Csnk2a2O54833 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms