Protein–RNA interactions for Protein: O54799

Nmbr, Neuromedin-B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbrO54799 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NmbrO54799 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NmbrO54799 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NmbrO54799 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NmbrO54799 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NmbrO54799 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NmbrO54799 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NmbrO54799 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NmbrO54799 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NmbrO54799 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NmbrO54799 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NmbrO54799 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NmbrO54799 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NmbrO54799 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NmbrO54799 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NmbrO54799 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NmbrO54799 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NmbrO54799 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NmbrO54799 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NmbrO54799 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NmbrO54799 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NmbrO54799 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NmbrO54799 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NmbrO54799 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NmbrO54799 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NmbrO54799 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NmbrO54799 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NmbrO54799 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NmbrO54799 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NmbrO54799 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NmbrO54799 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NmbrO54799 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NmbrO54799 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NmbrO54799 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NmbrO54799 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NmbrO54799 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NmbrO54799 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NmbrO54799 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NmbrO54799 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NmbrO54799 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NmbrO54799 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NmbrO54799 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NmbrO54799 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms