Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DffaO54786 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DffaO54786 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DffaO54786 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DffaO54786 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DffaO54786 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DffaO54786 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DffaO54786 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DffaO54786 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DffaO54786 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DffaO54786 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DffaO54786 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DffaO54786 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DffaO54786 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DffaO54786 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DffaO54786 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DffaO54786 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DffaO54786 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DffaO54786 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DffaO54786 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DffaO54786 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DffaO54786 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DffaO54786 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DffaO54786 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
DffaO54786 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DffaO54786 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DffaO54786 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DffaO54786 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DffaO54786 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DffaO54786 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DffaO54786 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DffaO54786 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DffaO54786 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DffaO54786 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DffaO54786 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DffaO54786 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DffaO54786 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DffaO54786 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DffaO54786 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DffaO54786 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
DffaO54786 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
DffaO54786 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DffaO54786 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DffaO54786 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
DffaO54786 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DffaO54786 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DffaO54786 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DffaO54786 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
DffaO54786 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DffaO54786 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DffaO54786 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DffaO54786 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DffaO54786 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DffaO54786 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DffaO54786 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DffaO54786 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DffaO54786 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
DffaO54786 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DffaO54786 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DffaO54786 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DffaO54786 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DffaO54786 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DffaO54786 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DffaO54786 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DffaO54786 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DffaO54786 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DffaO54786 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DffaO54786 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DffaO54786 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DffaO54786 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DffaO54786 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DffaO54786 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DffaO54786 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DffaO54786 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DffaO54786 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DffaO54786 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DffaO54786 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DffaO54786 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DffaO54786 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DffaO54786 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DffaO54786 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DffaO54786 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
DffaO54786 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DffaO54786 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DffaO54786 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DffaO54786 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DffaO54786 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DffaO54786 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DffaO54786 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DffaO54786 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DffaO54786 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DffaO54786 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DffaO54786 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DffaO54786 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DffaO54786 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DffaO54786 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DffaO54786 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DffaO54786 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DffaO54786 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DffaO54786 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms