Protein–RNA interactions for Protein: O54781

Srpk2, SRSF protein kinase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk2O54781 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Srpk2O54781 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Srpk2O54781 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Srpk2O54781 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Srpk2O54781 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Srpk2O54781 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Srpk2O54781 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Srpk2O54781 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Srpk2O54781 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Srpk2O54781 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Srpk2O54781 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Srpk2O54781 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Srpk2O54781 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Srpk2O54781 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Srpk2O54781 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Srpk2O54781 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Srpk2O54781 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Srpk2O54781 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Srpk2O54781 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Srpk2O54781 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Srpk2O54781 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Srpk2O54781 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Srpk2O54781 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Srpk2O54781 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Srpk2O54781 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Srpk2O54781 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Srpk2O54781 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Srpk2O54781 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Srpk2O54781 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Srpk2O54781 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Srpk2O54781 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Srpk2O54781 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Srpk2O54781 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Srpk2O54781 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Srpk2O54781 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Srpk2O54781 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Srpk2O54781 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Srpk2O54781 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Srpk2O54781 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Srpk2O54781 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Srpk2O54781 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Srpk2O54781 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Srpk2O54781 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Srpk2O54781 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Srpk2O54781 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Srpk2O54781 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Srpk2O54781 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Srpk2O54781 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Srpk2O54781 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Srpk2O54781 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Srpk2O54781 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Srpk2O54781 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Srpk2O54781 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Srpk2O54781 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Srpk2O54781 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Srpk2O54781 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Srpk2O54781 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Srpk2O54781 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Srpk2O54781 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Srpk2O54781 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Srpk2O54781 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Srpk2O54781 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Srpk2O54781 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Srpk2O54781 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Srpk2O54781 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Srpk2O54781 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Srpk2O54781 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Srpk2O54781 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Srpk2O54781 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Srpk2O54781 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Srpk2O54781 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Srpk2O54781 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Srpk2O54781 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Srpk2O54781 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Srpk2O54781 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Srpk2O54781 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Srpk2O54781 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Srpk2O54781 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Srpk2O54781 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Srpk2O54781 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
Srpk2O54781 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Srpk2O54781 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Srpk2O54781 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Srpk2O54781 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Srpk2O54781 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Srpk2O54781 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Srpk2O54781 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Srpk2O54781 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Srpk2O54781 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Srpk2O54781 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Srpk2O54781 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Srpk2O54781 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Srpk2O54781 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Srpk2O54781 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Srpk2O54781 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Srpk2O54781 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Srpk2O54781 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Srpk2O54781 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Srpk2O54781 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Srpk2O54781 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms