Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sdc4O35988 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sdc4O35988 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sdc4O35988 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sdc4O35988 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sdc4O35988 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sdc4O35988 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sdc4O35988 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sdc4O35988 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sdc4O35988 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sdc4O35988 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sdc4O35988 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sdc4O35988 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sdc4O35988 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sdc4O35988 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sdc4O35988 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sdc4O35988 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sdc4O35988 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sdc4O35988 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Sdc4O35988 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Sdc4O35988 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sdc4O35988 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sdc4O35988 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sdc4O35988 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sdc4O35988 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sdc4O35988 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sdc4O35988 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sdc4O35988 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sdc4O35988 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sdc4O35988 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sdc4O35988 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Sdc4O35988 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Sdc4O35988 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sdc4O35988 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sdc4O35988 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sdc4O35988 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sdc4O35988 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sdc4O35988 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sdc4O35988 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sdc4O35988 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sdc4O35988 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sdc4O35988 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sdc4O35988 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sdc4O35988 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms