Protein–RNA interactions for Protein: O35906

Spib, Transcription factor Spi-B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpibO35906 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SpibO35906 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SpibO35906 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SpibO35906 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SpibO35906 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SpibO35906 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SpibO35906 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SpibO35906 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SpibO35906 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SpibO35906 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SpibO35906 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SpibO35906 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SpibO35906 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SpibO35906 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SpibO35906 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SpibO35906 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SpibO35906 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SpibO35906 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SpibO35906 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SpibO35906 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SpibO35906 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SpibO35906 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SpibO35906 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SpibO35906 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SpibO35906 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SpibO35906 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SpibO35906 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SpibO35906 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SpibO35906 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SpibO35906 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SpibO35906 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SpibO35906 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SpibO35906 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SpibO35906 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SpibO35906 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SpibO35906 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SpibO35906 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SpibO35906 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SpibO35906 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SpibO35906 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SpibO35906 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SpibO35906 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SpibO35906 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SpibO35906 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SpibO35906 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SpibO35906 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SpibO35906 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SpibO35906 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SpibO35906 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SpibO35906 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SpibO35906 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SpibO35906 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SpibO35906 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SpibO35906 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SpibO35906 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SpibO35906 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SpibO35906 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SpibO35906 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SpibO35906 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SpibO35906 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SpibO35906 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SpibO35906 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SpibO35906 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SpibO35906 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SpibO35906 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SpibO35906 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SpibO35906 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SpibO35906 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SpibO35906 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SpibO35906 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SpibO35906 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SpibO35906 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SpibO35906 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SpibO35906 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SpibO35906 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SpibO35906 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SpibO35906 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SpibO35906 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SpibO35906 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SpibO35906 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SpibO35906 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SpibO35906 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SpibO35906 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SpibO35906 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SpibO35906 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SpibO35906 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SpibO35906 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SpibO35906 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SpibO35906 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SpibO35906 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SpibO35906 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SpibO35906 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SpibO35906 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SpibO35906 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SpibO35906 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SpibO35906 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SpibO35906 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SpibO35906 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SpibO35906 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SpibO35906 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms