Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clk2O35491 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Clk2O35491 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clk2O35491 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clk2O35491 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Clk2O35491 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clk2O35491 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clk2O35491 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Clk2O35491 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clk2O35491 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clk2O35491 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clk2O35491 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clk2O35491 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clk2O35491 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clk2O35491 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Clk2O35491 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Clk2O35491 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clk2O35491 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clk2O35491 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Clk2O35491 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clk2O35491 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clk2O35491 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clk2O35491 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clk2O35491 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clk2O35491 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clk2O35491 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Clk2O35491 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clk2O35491 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clk2O35491 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Clk2O35491 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clk2O35491 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Clk2O35491 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clk2O35491 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Clk2O35491 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Clk2O35491 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clk2O35491 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clk2O35491 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Clk2O35491 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clk2O35491 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clk2O35491 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Clk2O35491 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clk2O35491 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clk2O35491 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clk2O35491 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Clk2O35491 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clk2O35491 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clk2O35491 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clk2O35491 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clk2O35491 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Clk2O35491 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clk2O35491 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clk2O35491 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clk2O35491 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clk2O35491 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clk2O35491 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Clk2O35491 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Clk2O35491 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clk2O35491 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clk2O35491 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clk2O35491 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clk2O35491 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Clk2O35491 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clk2O35491 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clk2O35491 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clk2O35491 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clk2O35491 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clk2O35491 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clk2O35491 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clk2O35491 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clk2O35491 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clk2O35491 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clk2O35491 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clk2O35491 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clk2O35491 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clk2O35491 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clk2O35491 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Clk2O35491 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clk2O35491 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clk2O35491 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clk2O35491 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clk2O35491 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clk2O35491 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clk2O35491 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clk2O35491 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Clk2O35491 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clk2O35491 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clk2O35491 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clk2O35491 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clk2O35491 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clk2O35491 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clk2O35491 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clk2O35491 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clk2O35491 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clk2O35491 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clk2O35491 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clk2O35491 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clk2O35491 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clk2O35491 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clk2O35491 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clk2O35491 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.4 ms