Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kpna3O35344 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kpna3O35344 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kpna3O35344 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kpna3O35344 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kpna3O35344 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kpna3O35344 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kpna3O35344 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kpna3O35344 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kpna3O35344 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kpna3O35344 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kpna3O35344 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kpna3O35344 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kpna3O35344 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kpna3O35344 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kpna3O35344 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kpna3O35344 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kpna3O35344 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kpna3O35344 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kpna3O35344 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kpna3O35344 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kpna3O35344 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kpna3O35344 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kpna3O35344 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kpna3O35344 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kpna3O35344 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kpna3O35344 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kpna3O35344 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kpna3O35344 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Kpna3O35344 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kpna3O35344 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Kpna3O35344 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kpna3O35344 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kpna3O35344 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kpna3O35344 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna3O35344 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna3O35344 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna3O35344 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna3O35344 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna3O35344 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna3O35344 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna3O35344 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna3O35344 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kpna3O35344 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kpna3O35344 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kpna3O35344 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kpna3O35344 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kpna3O35344 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kpna3O35344 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kpna3O35344 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kpna3O35344 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kpna3O35344 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kpna3O35344 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kpna3O35344 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kpna3O35344 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kpna3O35344 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kpna3O35344 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kpna3O35344 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Kpna3O35344 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kpna3O35344 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kpna3O35344 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms