Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bhlhe40O35185 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bhlhe40O35185 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bhlhe40O35185 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bhlhe40O35185 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bhlhe40O35185 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bhlhe40O35185 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bhlhe40O35185 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bhlhe40O35185 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bhlhe40O35185 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bhlhe40O35185 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bhlhe40O35185 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Bhlhe40O35185 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bhlhe40O35185 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bhlhe40O35185 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bhlhe40O35185 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bhlhe40O35185 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Bhlhe40O35185 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bhlhe40O35185 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bhlhe40O35185 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bhlhe40O35185 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bhlhe40O35185 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Bhlhe40O35185 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bhlhe40O35185 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bhlhe40O35185 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bhlhe40O35185 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bhlhe40O35185 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Bhlhe40O35185 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bhlhe40O35185 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bhlhe40O35185 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bhlhe40O35185 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bhlhe40O35185 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bhlhe40O35185 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bhlhe40O35185 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bhlhe40O35185 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bhlhe40O35185 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bhlhe40O35185 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bhlhe40O35185 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bhlhe40O35185 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Bhlhe40O35185 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bhlhe40O35185 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bhlhe40O35185 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bhlhe40O35185 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bhlhe40O35185 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bhlhe40O35185 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Bhlhe40O35185 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Bhlhe40O35185 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms