Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sypl1O09117 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms