Protein–RNA interactions for Protein: O09010

Lfng, Beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase lunatic fringe, mousemouse

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LfngO09010 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LfngO09010 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LfngO09010 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LfngO09010 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LfngO09010 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LfngO09010 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LfngO09010 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LfngO09010 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LfngO09010 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LfngO09010 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LfngO09010 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LfngO09010 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LfngO09010 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LfngO09010 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LfngO09010 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LfngO09010 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LfngO09010 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LfngO09010 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LfngO09010 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LfngO09010 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LfngO09010 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LfngO09010 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LfngO09010 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LfngO09010 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LfngO09010 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LfngO09010 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LfngO09010 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LfngO09010 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LfngO09010 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LfngO09010 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LfngO09010 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LfngO09010 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LfngO09010 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LfngO09010 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LfngO09010 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LfngO09010 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LfngO09010 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LfngO09010 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LfngO09010 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LfngO09010 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LfngO09010 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LfngO09010 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LfngO09010 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LfngO09010 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LfngO09010 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LfngO09010 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LfngO09010 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LfngO09010 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LfngO09010 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LfngO09010 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LfngO09010 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LfngO09010 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LfngO09010 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LfngO09010 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LfngO09010 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LfngO09010 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LfngO09010 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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LfngO09010 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LfngO09010 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LfngO09010 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LfngO09010 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LfngO09010 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LfngO09010 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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LfngO09010 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LfngO09010 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LfngO09010 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LfngO09010 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LfngO09010 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LfngO09010 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LfngO09010 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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LfngO09010 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LfngO09010 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LfngO09010 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LfngO09010 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LfngO09010 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LfngO09010 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LfngO09010 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LfngO09010 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LfngO09010 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LfngO09010 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LfngO09010 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LfngO09010 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LfngO09010 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LfngO09010 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LfngO09010 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LfngO09010 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LfngO09010 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LfngO09010 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LfngO09010 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LfngO09010 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LfngO09010 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms