Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Dctn1O08788 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Dctn1O08788 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Dctn1O08788 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Dctn1O08788 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Dctn1O08788 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Dctn1O08788 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Dctn1O08788 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Dctn1O08788 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dctn1O08788 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dctn1O08788 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Dctn1O08788 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dctn1O08788 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dctn1O08788 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dctn1O08788 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dctn1O08788 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Dctn1O08788 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dctn1O08788 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dctn1O08788 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dctn1O08788 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dctn1O08788 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dctn1O08788 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dctn1O08788 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dctn1O08788 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dctn1O08788 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dctn1O08788 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dctn1O08788 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dctn1O08788 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dctn1O08788 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dctn1O08788 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dctn1O08788 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dctn1O08788 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dctn1O08788 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dctn1O08788 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dctn1O08788 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dctn1O08788 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dctn1O08788 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dctn1O08788 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Dctn1O08788 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dctn1O08788 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dctn1O08788 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dctn1O08788 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dctn1O08788 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dctn1O08788 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dctn1O08788 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dctn1O08788 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dctn1O08788 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dctn1O08788 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dctn1O08788 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dctn1O08788 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dctn1O08788 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Dctn1O08788 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dctn1O08788 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dctn1O08788 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dctn1O08788 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dctn1O08788 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dctn1O08788 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dctn1O08788 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dctn1O08788 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dctn1O08788 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Dctn1O08788 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dctn1O08788 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Dctn1O08788 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dctn1O08788 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dctn1O08788 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Dctn1O08788 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dctn1O08788 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dctn1O08788 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dctn1O08788 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dctn1O08788 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dctn1O08788 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dctn1O08788 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dctn1O08788 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Dctn1O08788 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dctn1O08788 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Dctn1O08788 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dctn1O08788 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dctn1O08788 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dctn1O08788 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dctn1O08788 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dctn1O08788 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dctn1O08788 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dctn1O08788 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dctn1O08788 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dctn1O08788 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dctn1O08788 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Dctn1O08788 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dctn1O08788 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dctn1O08788 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dctn1O08788 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dctn1O08788 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dctn1O08788 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dctn1O08788 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dctn1O08788 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dctn1O08788 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dctn1O08788 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dctn1O08788 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dctn1O08788 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Dctn1O08788 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Dctn1O08788 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms