Protein–RNA interactions for Protein: O08638

Myh11, Myosin-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh11O08638 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Myh11O08638 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myh11O08638 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myh11O08638 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myh11O08638 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myh11O08638 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myh11O08638 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Myh11O08638 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myh11O08638 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myh11O08638 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Myh11O08638 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myh11O08638 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Myh11O08638 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myh11O08638 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Myh11O08638 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myh11O08638 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Myh11O08638 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myh11O08638 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myh11O08638 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Myh11O08638 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Myh11O08638 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myh11O08638 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myh11O08638 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myh11O08638 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myh11O08638 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myh11O08638 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Myh11O08638 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myh11O08638 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myh11O08638 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myh11O08638 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myh11O08638 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myh11O08638 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myh11O08638 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myh11O08638 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Myh11O08638 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Myh11O08638 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Myh11O08638 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Myh11O08638 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Myh11O08638 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Myh11O08638 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Myh11O08638 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myh11O08638 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myh11O08638 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myh11O08638 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myh11O08638 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myh11O08638 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myh11O08638 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Myh11O08638 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myh11O08638 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Myh11O08638 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myh11O08638 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Myh11O08638 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Myh11O08638 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Myh11O08638 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myh11O08638 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Myh11O08638 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myh11O08638 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myh11O08638 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myh11O08638 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myh11O08638 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Myh11O08638 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Myh11O08638 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Myh11O08638 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Myh11O08638 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Myh11O08638 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Myh11O08638 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Myh11O08638 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Myh11O08638 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Myh11O08638 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myh11O08638 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myh11O08638 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myh11O08638 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myh11O08638 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myh11O08638 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myh11O08638 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myh11O08638 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Myh11O08638 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Myh11O08638 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Myh11O08638 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Myh11O08638 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Myh11O08638 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Myh11O08638 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Myh11O08638 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Myh11O08638 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Myh11O08638 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Myh11O08638 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Myh11O08638 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myh11O08638 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myh11O08638 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myh11O08638 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myh11O08638 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myh11O08638 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myh11O08638 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Myh11O08638 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myh11O08638 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myh11O08638 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myh11O08638 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myh11O08638 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myh11O08638 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Myh11O08638 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms