Protein–RNA interactions for Protein: O08574

Mesp2, Mesoderm posterior protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp2O08574 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mesp2O08574 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Mesp2O08574 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mesp2O08574 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mesp2O08574 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mesp2O08574 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mesp2O08574 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Mesp2O08574 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Mesp2O08574 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms