Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MsmbO08540 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MsmbO08540 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MsmbO08540 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MsmbO08540 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MsmbO08540 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MsmbO08540 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MsmbO08540 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MsmbO08540 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MsmbO08540 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
MsmbO08540 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
MsmbO08540 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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