Protein–RNA interactions for Protein: O08529

Capn2, Calpain-2 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn2O08529 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Capn2O08529 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Capn2O08529 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Capn2O08529 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Capn2O08529 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Capn2O08529 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Capn2O08529 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Capn2O08529 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn2O08529 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn2O08529 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn2O08529 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn2O08529 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn2O08529 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn2O08529 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn2O08529 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn2O08529 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn2O08529 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Capn2O08529 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn2O08529 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn2O08529 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn2O08529 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn2O08529 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn2O08529 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Capn2O08529 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capn2O08529 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capn2O08529 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capn2O08529 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Capn2O08529 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Capn2O08529 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn2O08529 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn2O08529 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn2O08529 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn2O08529 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn2O08529 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn2O08529 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn2O08529 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn2O08529 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn2O08529 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn2O08529 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn2O08529 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn2O08529 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn2O08529 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Capn2O08529 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn2O08529 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn2O08529 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn2O08529 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn2O08529 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn2O08529 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn2O08529 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn2O08529 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn2O08529 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn2O08529 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Capn2O08529 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn2O08529 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn2O08529 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn2O08529 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn2O08529 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn2O08529 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn2O08529 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn2O08529 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Capn2O08529 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn2O08529 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn2O08529 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn2O08529 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn2O08529 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn2O08529 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn2O08529 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn2O08529 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Capn2O08529 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn2O08529 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn2O08529 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn2O08529 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn2O08529 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn2O08529 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Capn2O08529 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn2O08529 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn2O08529 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn2O08529 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn2O08529 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn2O08529 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn2O08529 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn2O08529 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn2O08529 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn2O08529 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn2O08529 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Capn2O08529 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn2O08529 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn2O08529 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn2O08529 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn2O08529 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn2O08529 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Capn2O08529 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn2O08529 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn2O08529 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn2O08529 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn2O08529 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn2O08529 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn2O08529 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn2O08529 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Capn2O08529 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms