Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp35M0QWN7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp35M0QWN7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp35M0QWN7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp35M0QWN7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp35M0QWN7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp35M0QWN7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp35M0QWN7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp35M0QWN7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp35M0QWN7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp35M0QWN7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp35M0QWN7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp35M0QWN7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp35M0QWN7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp35M0QWN7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp35M0QWN7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp35M0QWN7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp35M0QWN7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp35M0QWN7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp35M0QWN7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp35M0QWN7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp35M0QWN7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp35M0QWN7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp35M0QWN7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp35M0QWN7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp35M0QWN7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp35M0QWN7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp35M0QWN7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp35M0QWN7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp35M0QWN7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp35M0QWN7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp35M0QWN7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp35M0QWN7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp35M0QWN7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp35M0QWN7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp35M0QWN7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp35M0QWN7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp35M0QWN7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp35M0QWN7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp35M0QWN7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp35M0QWN7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp35M0QWN7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp35M0QWN7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp35M0QWN7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp35M0QWN7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp35M0QWN7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp35M0QWN7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp35M0QWN7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp35M0QWN7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp35M0QWN7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp35M0QWN7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp35M0QWN7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp35M0QWN7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp35M0QWN7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp35M0QWN7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp35M0QWN7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Usp35M0QWN7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp35M0QWN7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp35M0QWN7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp35M0QWN7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp35M0QWN7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp35M0QWN7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp35M0QWN7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp35M0QWN7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Usp35M0QWN7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp35M0QWN7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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Usp35M0QWN7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp35M0QWN7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp35M0QWN7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp35M0QWN7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Usp35M0QWN7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp35M0QWN7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp35M0QWN7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp35M0QWN7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp35M0QWN7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp35M0QWN7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp35M0QWN7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp35M0QWN7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Usp35M0QWN7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Usp35M0QWN7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Usp35M0QWN7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Usp35M0QWN7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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