Protein–RNA interactions for Protein: L7N253

4930555G01Rik, RIKEN cDNA 4930555G01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930555G01RikL7N253 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930555G01RikL7N253 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
4930555G01RikL7N253 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
4930555G01RikL7N253 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930555G01RikL7N253 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930555G01RikL7N253 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930555G01RikL7N253 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930555G01RikL7N253 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930555G01RikL7N253 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930555G01RikL7N253 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930555G01RikL7N253 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930555G01RikL7N253 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930555G01RikL7N253 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930555G01RikL7N253 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930555G01RikL7N253 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930555G01RikL7N253 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930555G01RikL7N253 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930555G01RikL7N253 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930555G01RikL7N253 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930555G01RikL7N253 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930555G01RikL7N253 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930555G01RikL7N253 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930555G01RikL7N253 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930555G01RikL7N253 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930555G01RikL7N253 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930555G01RikL7N253 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930555G01RikL7N253 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms