Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm20939L7N243 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms