Protein–RNA interactions for Protein: L7N232

Zfp955b, Zinc finger protein 955B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp955bL7N232 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Zfp955bL7N232 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zfp955bL7N232 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zfp955bL7N232 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Zfp955bL7N232 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zfp955bL7N232 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zfp955bL7N232 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Zfp955bL7N232 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Zfp955bL7N232 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zfp955bL7N232 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zfp955bL7N232 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zfp955bL7N232 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zfp955bL7N232 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zfp955bL7N232 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zfp955bL7N232 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zfp955bL7N232 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zfp955bL7N232 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zfp955bL7N232 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zfp955bL7N232 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zfp955bL7N232 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Zfp955bL7N232 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp955bL7N232 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp955bL7N232 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp955bL7N232 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp955bL7N232 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp955bL7N232 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp955bL7N232 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp955bL7N232 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp955bL7N232 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp955bL7N232 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Zfp955bL7N232 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zfp955bL7N232 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zfp955bL7N232 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zfp955bL7N232 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zfp955bL7N232 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zfp955bL7N232 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zfp955bL7N232 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zfp955bL7N232 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Zfp955bL7N232 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 208.2 ms