Protein–RNA interactions for Protein: K9J7F4

Gm8720, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8720K9J7F4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm8720K9J7F4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8720K9J7F4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8720K9J7F4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8720K9J7F4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8720K9J7F4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8720K9J7F4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8720K9J7F4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8720K9J7F4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8720K9J7F4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8720K9J7F4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8720K9J7F4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8720K9J7F4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8720K9J7F4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8720K9J7F4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8720K9J7F4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8720K9J7F4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8720K9J7F4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8720K9J7F4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8720K9J7F4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8720K9J7F4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm8720K9J7F4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8720K9J7F4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8720K9J7F4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8720K9J7F4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8720K9J7F4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8720K9J7F4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8720K9J7F4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8720K9J7F4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8720K9J7F4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8720K9J7F4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8720K9J7F4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8720K9J7F4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm8720K9J7F4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms