Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ27

Ccdc191, Coiled-coil domain-containing 191, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc191J3QQ27 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc191J3QQ27 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc191J3QQ27 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc191J3QQ27 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc191J3QQ27 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc191J3QQ27 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc191J3QQ27 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc191J3QQ27 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc191J3QQ27 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc191J3QQ27 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc191J3QQ27 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc191J3QQ27 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc191J3QQ27 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc191J3QQ27 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc191J3QQ27 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc191J3QQ27 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc191J3QQ27 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc191J3QQ27 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc191J3QQ27 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc191J3QQ27 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc191J3QQ27 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc191J3QQ27 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc191J3QQ27 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc191J3QQ27 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc191J3QQ27 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc191J3QQ27 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc191J3QQ27 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc191J3QQ27 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc191J3QQ27 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc191J3QQ27 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc191J3QQ27 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc191J3QQ27 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc191J3QQ27 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc191J3QQ27 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc191J3QQ27 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc191J3QQ27 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc191J3QQ27 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc191J3QQ27 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc191J3QQ27 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc191J3QQ27 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc191J3QQ27 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc191J3QQ27 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc191J3QQ27 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc191J3QQ27 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc191J3QQ27 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc191J3QQ27 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms