Protein–RNA interactions for Protein: J3QPI0

Gm8298, Predicted gene 8298, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8298J3QPI0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm8298J3QPI0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm8298J3QPI0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm8298J3QPI0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm8298J3QPI0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm8298J3QPI0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm8298J3QPI0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm8298J3QPI0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm8298J3QPI0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm8298J3QPI0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm8298J3QPI0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm8298J3QPI0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm8298J3QPI0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gm8298J3QPI0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm8298J3QPI0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm8298J3QPI0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm8298J3QPI0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gm8298J3QPI0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm8298J3QPI0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm8298J3QPI0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm8298J3QPI0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm8298J3QPI0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm8298J3QPI0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm8298J3QPI0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm8298J3QPI0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm8298J3QPI0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm8298J3QPI0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm8298J3QPI0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm8298J3QPI0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm8298J3QPI0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm8298J3QPI0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm8298J3QPI0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm8298J3QPI0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms