Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm21972J3QN38 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm21972J3QN38 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms