Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ9

Gm20873, Predicted gene, 20873, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm20873J3QMQ9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Gm20873J3QMQ9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
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Gm20873J3QMQ9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Gm20873J3QMQ9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Gm20873J3QMQ9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm20873J3QMQ9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm20873J3QMQ9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gm20873J3QMQ9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Gm20873J3QMQ9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20873J3QMQ9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20873J3QMQ9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20873J3QMQ9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20873J3QMQ9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20873J3QMQ9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20873J3QMQ9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm20873J3QMQ9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20873J3QMQ9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20873J3QMQ9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20873J3QMQ9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Gm20873J3QMQ9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20873J3QMQ9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20873J3QMQ9 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20873J3QMQ9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm20873J3QMQ9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm20873J3QMQ9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm20873J3QMQ9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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