Protein–RNA interactions for Protein: J3QMN6

Fmo6, Flavin-containing monooxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmo6J3QMN6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fmo6J3QMN6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fmo6J3QMN6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fmo6J3QMN6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fmo6J3QMN6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fmo6J3QMN6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fmo6J3QMN6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fmo6J3QMN6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fmo6J3QMN6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fmo6J3QMN6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fmo6J3QMN6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fmo6J3QMN6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fmo6J3QMN6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fmo6J3QMN6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Fmo6J3QMN6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fmo6J3QMN6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fmo6J3QMN6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fmo6J3QMN6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fmo6J3QMN6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fmo6J3QMN6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fmo6J3QMN6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fmo6J3QMN6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fmo6J3QMN6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Fmo6J3QMN6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fmo6J3QMN6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fmo6J3QMN6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fmo6J3QMN6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fmo6J3QMN6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fmo6J3QMN6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fmo6J3QMN6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fmo6J3QMN6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fmo6J3QMN6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fmo6J3QMN6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fmo6J3QMN6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fmo6J3QMN6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fmo6J3QMN6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fmo6J3QMN6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fmo6J3QMN6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Fmo6J3QMN6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fmo6J3QMN6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fmo6J3QMN6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fmo6J3QMN6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fmo6J3QMN6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fmo6J3QMN6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fmo6J3QMN6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms