Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA2

Gm28051, Predicted gene, 28051, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28051J3QMA2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm28051J3QMA2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm28051J3QMA2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms