Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pot1bH7BX60 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pot1bH7BX60 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pot1bH7BX60 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pot1bH7BX60 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pot1bH7BX60 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pot1bH7BX60 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pot1bH7BX60 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pot1bH7BX60 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pot1bH7BX60 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pot1bH7BX60 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Pot1bH7BX60 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Pot1bH7BX60 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms