Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Pcf11G3X9Z4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Pcf11G3X9Z4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Pcf11G3X9Z4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Pcf11G3X9Z4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Pcf11G3X9Z4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Pcf11G3X9Z4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
Pcf11G3X9Z4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Pcf11G3X9Z4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Pcf11G3X9Z4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Pcf11G3X9Z4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.65
Pcf11G3X9Z4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
Pcf11G3X9Z4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
Pcf11G3X9Z4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Pcf11G3X9Z4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Pcf11G3X9Z4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Pcf11G3X9Z4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Pcf11G3X9Z4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Pcf11G3X9Z4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Pcf11G3X9Z4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Pcf11G3X9Z4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Pcf11G3X9Z4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Pcf11G3X9Z4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Pcf11G3X9Z4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Pcf11G3X9Z4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Pcf11G3X9Z4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Pcf11G3X9Z4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Pcf11G3X9Z4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Pcf11G3X9Z4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Pcf11G3X9Z4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Pcf11G3X9Z4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
Pcf11G3X9Z4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Pcf11G3X9Z4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Pcf11G3X9Z4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Pcf11G3X9Z4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Pcf11G3X9Z4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
Pcf11G3X9Z4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
Pcf11G3X9Z4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Pcf11G3X9Z4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Pcf11G3X9Z4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Pcf11G3X9Z4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Pcf11G3X9Z4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Pcf11G3X9Z4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Pcf11G3X9Z4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Pcf11G3X9Z4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Pcf11G3X9Z4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
Pcf11G3X9Z4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Pcf11G3X9Z4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
Pcf11G3X9Z4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Pcf11G3X9Z4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Pcf11G3X9Z4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Pcf11G3X9Z4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Pcf11G3X9Z4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Pcf11G3X9Z4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
Pcf11G3X9Z4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Pcf11G3X9Z4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Pcf11G3X9Z4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
Pcf11G3X9Z4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Pcf11G3X9Z4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Pcf11G3X9Z4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Pcf11G3X9Z4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Pcf11G3X9Z4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Pcf11G3X9Z4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Pcf11G3X9Z4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Pcf11G3X9Z4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Pcf11G3X9Z4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Pcf11G3X9Z4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Pcf11G3X9Z4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Pcf11G3X9Z4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Pcf11G3X9Z4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Pcf11G3X9Z4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Pcf11G3X9Z4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Pcf11G3X9Z4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Pcf11G3X9Z4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Pcf11G3X9Z4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Pcf11G3X9Z4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Pcf11G3X9Z4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Pcf11G3X9Z4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Pcf11G3X9Z4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
Pcf11G3X9Z4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Pcf11G3X9Z4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
Pcf11G3X9Z4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Pcf11G3X9Z4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Pcf11G3X9Z4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Pcf11G3X9Z4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Pcf11G3X9Z4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Pcf11G3X9Z4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Pcf11G3X9Z4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Pcf11G3X9Z4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
Pcf11G3X9Z4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Pcf11G3X9Z4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Pcf11G3X9Z4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Pcf11G3X9Z4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Pcf11G3X9Z4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Pcf11G3X9Z4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Pcf11G3X9Z4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Pcf11G3X9Z4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Pcf11G3X9Z4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Pcf11G3X9Z4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Pcf11G3X9Z4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms